一、牙齒表面：牙釉質表面色調的改變

1.食用含高色素的食物或飲料，如茶或咖啡，黏性強的褐或黑色造成牙齒色澤改變。

2.吸煙者常常會造成牙齒齒頸部，特別是舌側面，有環狀層次的深度染色。

3.因咀嚼菸草而造成牙齒染色者，會在牙釉質的裂隙深層發現染色。

二、牙齒深層：齒質本身色調的改變

1.氟化物造成（常發生於牙釉質形成及鈣化時間）孕婦在懷孕三個月到小孩八歲期間若過度暴露於含氟的情況下，牙齒會造成嚴重程度不等的染色。牙齒表現出礦物化不良且多孔性的牙釉質底層，但是礦物化良好的牙釉質表層，這種牙釉質發育不良的現象稱作斑釉質（mottled enamel）。

2.抗生素造成（特別是牙齒形成時間）牙齒受到四環黴素影響的主要時間為懷孕階段的第二期到八歲。染色的嚴重性及色澤的差異主要取決於四環黴素種類的使用、使用時間的長短及使用時牙齒形成的階段。

3. 系統性疾病造成：在胎兒時期有嚴重黃疸的小孩，由於血液中過多紅血球遭受到破壞，因而血紅素的代謝產物膽紅素無法適時的排出，所以在乳牙的牙本質常有淺藍青色或褐色的血鐵質沉著。

4.局部因素造成：齲齒是造成色素沉著的主要原因。另外，複合樹脂或銀粉等填補材料亦會因為填補後經歷的時間長久或牙釉質過薄等因素呈現牙齒變色的現象。材料使用的時間長短不同決定色素的沉積量，同時與日後治療的效果息息相關。

5.生理因素造成：由於長期的飲食習慣累積了牙齒染色的結果，而且隨著年紀的增加，牙齒表面產生的裂隙也相對的增加，造成色素可能深入其中的牙本質結構。另外，年長者因為牙釉質磨損變薄減少了透明層，加上色澤較深具保護機轉的修復性牙本質的產生，因而使得牙齒顏色加深。